Vedoucí: RNDr. Andrea Mančíková, Ph.D.
Činnost pracoviště sdružujícího 3 národní referenční laboratoře (NRL) je zaměřena zejména na diagnostiku alimentárních bakteriálních infekcí zahrnující též stafylokokové infekce.
Aktivity oddělení jsou zaměřeny do několika hlavních směrů: a) diagnostika bakteriálních agens a průkaz toxinů, b) molekulární typizace vybraných izolátů
Oddělení je akreditováno ČIA.