Vedoucí: MUDr. Jana Kozáková
Kontakt- telefon: 724 810 126, 267 082 260, e-mail: jana.kozakova@szu.cz
Pracoviště je akreditované ČIA jako zdravotnická laboratoř podle ČSN EN ISO 15189.
- Druhové zařazení zejména obtížně identifikovatelných kmenů streptokoků a enterokoků pro mikrobiologická a klinická pracoviště celé ČR a NRL pro antibiotika
- Určení příslušnosti kmenů streptokoků a enterokoků k sérologickým skupinám A-Z
- Sérotypizace a molekulárně genetická typizace kmenů. Výsledky jsou využity pro epidemiologické účely, pro vyhledávání zdroje a šíření infekce, distribuce sérotypů pro přípravu typově specifických vakcín a kontrolu efektivity jejich podání:
- S. pneumoniae – PCR a Quellung reakcí (Formulář IPO)
- S. agalactiae – latexaglutinací a metodou multiplex PCR
- S. pyogenes – sekvenační analýzou emm genu pro M protein (Formulář GAS)
- Multilokusová sekvenační typizace (MLST) vybraných kmenů pyogenes a S. agalactiae izolovaných z invazivních onemocnění
- Celogenomová sekvenace (Whole genome sequencing, WGS) u vybraných streptokoků izolovaných z invazivních onemocnění
- Detekce faktorů virulence u vybraných kmenů pyogenes metodou RT – PCR
- Zajištění celorepublikového programu Surveillance invazivních onemocnění vyvolaných S. pneumoniae
- V případě potřeby organizace aktivního programu surveillance invazivních onemocnění vyvolaných pyogenes a novorozeneckých onemocnění působených S. agalactiae
- Spravování sbírky referenčních prototypových kultur streptokoků a enterokoků, poskytování těchto kultury v rámci ČR i zahraničí
- Spravování sbírky kmenů všech streptokoků a enterokoků izolovaných z invazivního onemocnění
- Spolupráce s Národní referenční laboratoře pro antibiotika na monitorování citlivosti pneumoniae
- Nové diagnostické metody dle aktuálních poznatků Úspěšná účast v systému mezinárodního hodnocení kvality (EQAS)
- Expertizní činnost
- Vyvíjení, úprava a zavádění nových laboratorních metod
- Řešení výzkumných a grantových projektů
- Přednášková, výuková, publikační a konzultační činnost
- V rámci aktivit ECDC podíl na řešení evropských výzkumných projektů, identifikace kmenů pro zahraniční pracoviště, účast na výuce zahraničních stážistů
- Hlášení do ECDC databáze TESSy (The European Surveillance System)
- Hlášení do mezinárodní databáze PubMLST (Public databases for molecular typing and microbial genome diversity)
- Účast v mezinárodních projektech: EU-IBD (European Invasive Bacterial Disease Surveillance Network), PSERENADE (The Pneumococcal Serotype Replacement and Distribution Estimation), IRIS (Invasive Respiratory Infections Surveillance)
Aktualizováno 6.12.2023