Národní referenční laboratoř pro streptokokové nákazy

Pracoviště je akreditované ČIA jako zdravotnická laboratoř podle ČSN EN ISO 15189.

• Druhové zařazení zejména obtížně identifikovatelných kmenů streptokoků a enterokoků pro mikrobiologická a klinická pracoviště celé ČR a NRL pro antibiotika
• Určení příslušnosti kmenů streptokoků a enterokoků k sérologickým skupinám A-Z
• Sérotypizace a molekulárně genetická typizace kmenů. Výsledky jsou využity pro epidemiologické účely, pro vyhledávání zdroje a šíření infekce, distribuce sérotypů pro přípravu typově specifických vakcín a kontrolu efektivity jejich podání:
• S. pneumoniae – PCR a Quellung reakcí (Formulář IPO)
• S. agalactiae – latexaglutinací a metodou multiplex PCR
• S. pyogenes –  sekvenační analýzou emm genu pro M protein (Formulář GAS)
• Detekce N. meningitidis, H. influenzae b a S. pneumoniae z klinického materiálu metodou Real-time PCR – hrazeno z prostředků zdravotních pojišťoven
• Multilokusová sekvenační typizace (MLST) vybraných kmenů pyogenes a S. agalactiae izolovaných z invazivních onemocnění
• Celogenomová sekvenace (Whole genome sequencing, WGS) u vybraných streptokoků izolovaných z invazivních onemocnění
• Detekce faktorů virulence u vybraných kmenů pyogenes metodou RT – PCR
• Zajištění celorepublikového programu Surveillance invazivních onemocnění vyvolaných S. pneumoniae
• V případě potřeby organizace aktivního programu surveillance invazivních onemocnění vyvolaných pyogenes a novorozeneckých onemocnění působených S. agalactiae
• Spravování sbírky referenčních prototypových kultur streptokoků a enterokoků, poskytování těchto kultury v rámci ČR i zahraničí
• Spravování sbírky kmenů všech streptokoků a enterokoků izolovaných z invazivního onemocnění
• Spolupráce s Národní referenční laboratoře pro antibiotika na monitorování citlivosti pneumoniae
• Nové diagnostické metody dle aktuálních poznatků Úspěšná účast v systému mezinárodního hodnocení kvality (EQAS)
• Expertizní činnost
• Vyvíjení, úprava a zavádění nových laboratorních metod
• Řešení výzkumných a grantových projektů
• Přednášková, výuková, publikační a konzultační činnost
• V rámci aktivit ECDC podíl na řešení evropských výzkumných projektů, identifikace kmenů pro zahraniční pracoviště, účast na výuce zahraničních stážistů
• Hlášení do ECDC databáze TESSy (The European Surveillance System)
• Hlášení do mezinárodní databáze PubMLST (Public databases for molecular typing and microbial genome diversity)
• Účast v mezinárodních projektech: EU-IBD (European Invasive Bacterial Disease Surveillance Network), PSERENADE (The Pneumococcal Serotype Replacement and Distribution Estimation), IRIS (Invasive Respiratory Infections Surveillance)

Aktualizováno 6.12.2023