Centra
Ředitel
Kancelář ředitele
Sekretariát
Podatelna
Pracoviště vzdělávání, výzkumu a zahraniční spolupráce
Krízové řízení
Středisko pro kvalitu a autorizaci (MUDr. Věra Chaloupková)
Oddělení biostatistiky (RNDr. M. Malý, CSc.)
Středisko vědeckých informací (Mgr. J. Veselá)
Odbor ICT (Jiří Haase)
Útvar ředitele
Tiskový mluvčí
Sekretariát Národního antibiotického program
Expertní skupina pro zkoušení způsobilosti
Expertní pracovní skupina Národní imunizační komise MZČR
Právní odbor (Mgr. T. Pechanová)
Personální odbor (p. H. Obdržálková)
Úsek náměstka pro ekonomickou a technickou činnost (ÚNETČ)
Sekretariát ÚNETČ
Ekonomický odbor
Firemní školka
Provozně technický odbor
Interní audit
Odborná centra
Centrum zdraví a životního prostředí (MUDr. H. Kazmarová)
Sekretariát centra
Oddělení hygieny ovzduší (RNDr. B. Kotlík)
Oddělení hygieny vody (MUDr. F. Kožíšek)
Ústředí monitoringu a zdravotního stavu obyvatelstva (MUDr. R. Kubínová)
Oddělení hygieny odpadů (MUDr. M. Zimová, CSc.)
Oddělení prvkové analýzy (Mgr. Kateřina Žádná)
Centrum zdraví, výživy a potravin (Prof. MVDr. J. Ruprich, CSc.)
Sekretariát
Oddělení analýzy bezpečnosti výživy a potravin (RNDr. I. Řehůřková, Ph.D)
Oddělení hodnocení zdravotních rizik a aplikované výživy (Prof. MVDr. J.Ruprich, CSc.)
Centrum hygieny práce a pracovního lékařství (MUDr. V. Lipšová)
Sekretariát
Oddělení chemické bezpečnosti (MUDr. M. Hornychová, CSc.)
Oddělení hygieny práce (MUDr. M. Vít, Ph.D.)
Oddělení pracovního lékařství (MUDr. V. Lipšová)
Oddělení pro hodnocení expozice chemickým látkám na pracovišti (RNDr. J. Mráz, CSc.)
Centrum podpory veřejného zdraví (MUDr. Marie Nejedlá)
Sekretariát
Národní manažer HIV/AIDS (MUDr. Anna Kubátová)
Oddělení podpory zdraví (MUDr. Alena Váňová.)
Oddělení determinant zdraví (Mgr. Lenka Laiblová)
Oddělení well-beingu dětí a mladistvých (Mgr. Simona Bernardyová)
Centrum epidemiologie a mikrobiologie (MUDr. Jana Kozáková)
Oddělení epidemiologie infekčních nemocí (MUDr. Jan Kynčl, PhD.)
Oddělení bakteriálních vzdušných nákaz (MUDr. Jana Kozáková)
Oddělení bakteriální rezistence k antibiotikům a sbírka kultur (Mgr. Vladislav Jakubů, Ph.D.)
Oddělení respiračních, střevních a exantematických virových nákaz (MUDr. Radomíra Limberková)
Oddělení sexuálně přenosných nemocí (STI) (MUDr. Hana Zákoucká)
Oddělení zoonóz s přírodní ohniskovostí (RNDr. Petr Kodym, CSc.)
Oddělení dezinfekce, dezinsekce a deratizace (DDD) (Ing. Jan Urban, Ph.D.)
Oddělení pro přípravu půd a umývárny (Ing. Dagmar Štětinová)
Oddělení stafylokokových a alimentárních bakteriálních infekcí (MVDr. Zuzana Ileninová, Ph.D.)
Centrum toxikologie a zdravotní bezpečnosti (MUDr. D.Jírová, CSc.)
Sekretariát
Oddělení pro chemickou bezpečnost výrobků (Ing. K.Vrbík)
Oddělení pro bezpečnost speciálních druhů potravin a mikrobiologii PBU (Ing. D.Winklerová)
Oddělení alternativních toxikologických metod (RNDr. K.Kejlová, Ph.D.)
Oddělení toxikogenomiky (Doc.RNDr. P.Souček, Ph.D.)
Oddělení biomedicíny (RNDr. H.Bendová, Ph.D.)
Oddělení welfare pokusných zvířat